Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPATO15228 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPATO15228 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPATO15228 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms