Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A2O14975 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms