Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS6O14544 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms