Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms