Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIP1O00291 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIP1O00291 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIP1O00291 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms