Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E9PCH4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
E9PCH4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
E9PCH4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
E9PCH4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
E9PCH4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
E9PCH4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
E9PCH4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
E9PCH4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
E9PCH4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
E9PCH4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
E9PCH4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E9PCH4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E9PCH4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms