Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVV-1B6SEH8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms