Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP73A6NFT4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP73A6NFT4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms