Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSDA5PKW4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms