Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS37CA5D8V6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS37CA5D8V6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms