Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CSPP1Q1MSJ5 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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