Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCGQ13326 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms