Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LYG2-206ENST00000626374 650 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PPP2R2B-211ENST00000508545 2042 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MEF2C-229ENST00000627659 2393 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PEX5L-209ENST00000468741 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 WDR11-AS1-203ENST00000598981 2242 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC003684.1-201ENST00000432442 1715 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RN7SL841P-201ENST00000470547 297 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RPS3P7-201ENST00000488662 726 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC007998.3-202ENST00000591141 697 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 OR1X1P-201ENST00000606159 931 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC073218.2-201ENST00000606468 295 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 C20orf78-202ENST00000623418 606 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC009148.1-201ENST00000570148 2693 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 SULT1C2-201ENST00000251481 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 HDAC9-212ENST00000432645 3099 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ELAVL2-203ENST00000380117 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 ZKSCAN3-202ENST00000341464 1794 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 MT-TS1-201ENST00000387416 69 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 FKBP1AP3-201ENST00000423650 319 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CACNB1Q02641 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms