Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SCG3Q8WXD2 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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