Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC38Q502W7 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms