Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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SEC23BQ15437 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SEC23BQ15437 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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