Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NWD1Q149M9 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms