Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CHD4Q14839 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHD4Q14839 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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