Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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