Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CDH18Q13634 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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CDH18Q13634 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CDH18Q13634 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CDH18Q13634 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CDH18Q13634 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CDH18Q13634 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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