Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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