Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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IFT88Q13099 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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