Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms