Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ZNF548Q8NEK5 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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