Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms