Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms