Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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