Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 HEPACAM2-202ENST00000394468 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms