Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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