Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BPTFQ12830 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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