Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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C4orf17Q53FE4 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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C4orf17Q53FE4 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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C4orf17Q53FE4 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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C4orf17Q53FE4 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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C4orf17Q53FE4 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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C4orf17Q53FE4 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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C4orf17Q53FE4 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
C4orf17Q53FE4 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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