Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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HERC1Q15751 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC1Q15751 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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