Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CHD4Q14839 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHD4Q14839 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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