Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms