Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SF3B2Q13435 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms