Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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