Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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