Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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PTPRMP28827 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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PTPRMP28827 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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PTPRMP28827 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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PTPRMP28827 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRMP28827 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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