Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PTPREP23469 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PTPREP23469 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PTPREP23469 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PTPREP23469 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PTPREP23469 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PTPREP23469 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PTPREP23469 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPREP23469 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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