Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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PKHD1P08F94 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
PKHD1P08F94 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PKHD1P08F94 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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