Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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LINC00587B1AMM8 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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LINC00587B1AMM8 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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LINC00587B1AMM8 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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LINC00587B1AMM8 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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LINC00587B1AMM8 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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LINC00587B1AMM8 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
LINC00587B1AMM8 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
LINC00587B1AMM8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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