Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SFRP4Q6FHJ7 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms