Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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RTL8BQ17RB0 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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RTL8BQ17RB0 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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RTL8BQ17RB0 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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RTL8BQ17RB0 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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RTL8BQ17RB0 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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RTL8BQ17RB0 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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RTL8BQ17RB0 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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RTL8BQ17RB0 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RTL8BQ17RB0 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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