Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTCH1Q13635 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTCH1Q13635 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTCH1Q13635 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTCH1Q13635 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTCH1Q13635 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTCH1Q13635 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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