Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD8P13378 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD8P13378 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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