Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms