Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ESRP1-203ENST00000433389 3770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL365436.1-201ENST00000452587 495 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SNPHO15079 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SNPHO15079 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FTH1P27-201ENST00000449509 551 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC104211.2-201ENST00000521317 436 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC004241.1-203ENST00000552502 460 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC093826.2-201ENST00000579042 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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