Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC85BQ15834 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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