Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms