Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms